2007年以來，在國務院的統一領導下，科技部會同國家發展改革委、財政部加強統籌協調和組織推動，有關組織部門和廣大科研工作者共同努力，重大專項進展順利，一批前期基礎好的重大攻關任務取得階段性創新成果。一是突破了一批重大裝備和產品，在應對國際金融危機中凸顯了重要作用。數控重型橋式龍門五軸聯動車銑復合機床、3.6萬噸黑色金屬垂直擠壓機等高檔數控機床和基礎制造裝備研發成功。65納米刻蝕機、離子注入機等集成電路裝備逐步走向市場。大型地震儀2000道樣機等用于油氣勘探的重大裝備進入樣機試制與組裝階段。二是突破了一批產業核心關鍵技術，在戰略性新興產業發展中發揮了先導作用。在具有自主知識產權的TD—SCDMA基礎上，研究開發了TD—LTE后續演進技術。我國提出的4G標準提案被國際電信聯盟（ITU）列為國際候選技術標準。在水污染治理技術方面，突破了化工、制藥等行業污染物減排多項關鍵技術。國產轉基因抗蟲棉推廣和產業化步伐進一步加快，市場占有率達到93%。轉植酸酶基因玉米和轉基因抗蟲水稻獲準進行大田區試，標志著我國生物育種產品研究開發取得新的進展。三是突破了傳染病防控和新藥創制關鍵技術，在保障人口健康等方面發揮了重要支撐作用。在傳染病防治方面，加強了傳染病防控網絡建設，在國際上率先成功開發了甲型H1N1疫苗并實現規模生產和大面積接種。在新藥開發方面，重組幽門螺旋桿菌（Hp）疫苗等8個品種獲得新藥證書，血脂康等多個具有我國自主知識產權的創新藥物已獲準在歐美國家開展臨床試驗。
科技重大專項投入強度大、實施周期長、涉及范圍廣，是一項極具挑戰性的復雜系統工程，我們著重推進了五方面工作。
第一，著力探索新型舉國體制。今天，我們組織實施重大專項，就要借鑒“兩彈一星”、載人航天的經驗，不斷完善市場經濟條件下的新型舉國體制，形成強大的科技攻堅合力，以科技發展的重點跨越帶動產業競爭能力的整體提升。近期，國務院又明確了各重大專項第一行政責任人和專職技術責任人，強化了各方職責，健全了行政和技術兩條線的組織管理體系。科技部、國家發展改革委、財政部等綜合部門重點加強了科技重大專項的綜合協調、整體設計和協同推進，進一步完善了科技重大專項的監督體系和評估體系。
第二，著力加強整體推進和科學管理。樹立大科學、大工程的觀念，采用系統工程的思維和方法，提高科技重大專項科學管理水平。一是加強統籌策劃和部署，明確重點工作和時間節點要求。二是加強協同推進，通過組織制訂技術路線圖、凝煉標志性成果和綜合平衡等工作，促進專項任務部署的系統性和集成性。三是建章立制，研究制訂項目、經費和知識產權等方面的管理規定。同時，建立信息管理系統等平臺，開通重大專項網站，以信息化支撐管理的科學化和規范化。
第三，著力強化系統部署和產業化環境建設。在任務安排上，瞄準產業發展的高端和前沿，遵循市場和產業發展規律，按照創新鏈和產業鏈上下游關系，系統部署各項任務。在組織推進上，要求瞄準專項產業化目標，建立“技術研究、產品開發、應用示范、市場推廣”的完備創新鏈，注重提升產業鏈各環節的創新能力，加快培育具有市場競爭力的戰略性新興產業。在政策環境建設上，制定切實可行的首臺（套）應用、稅收優惠等配套激勵政策。
第四，著力促進產學研用結合。對于重大產品和重大工程類項目，強調由企業牽頭承擔，同時注重發揮科研院所和高等院校的作用，鼓勵采用業主負責制、用戶考核制等實施方式，建立健全了產學研用相結合的組織實施機制。結合國家技術創新工程的實施，以科技重大專項為載體推進產業技術創新戰略聯盟建設，促進了科技與經濟的有機結合。
第五，著力凝聚高層次創新創業人才。廣聚人才是實施好科技重大專項的關鍵。目前，科技重大專項已經吸引了一大批活躍在科研和生產一線的最優秀人才，凝聚了我國一流的科研機構、高等院校和創新型企業的核心團隊。依托“千人計劃”，重大專項目前已吸引了50多名海外高層次創新人才參與。科技重大專項已成為凝聚和造就優秀創新創業人才的重要平臺，也正在成為優秀人才成就事業、實現價值的重要舞臺。
科技部和有關部門將堅持以科學發展觀為指導，加快重大專項的實施進程，力爭早出成果、快見成效，更好地發揮科技支撐引領作用，實現創新驅動發展。
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