1993年，"上海市科協第五屆青年優秀科技論文一等獎"
1997年，中國科學技術協會第五屆“中國青年科技獎”
1998年，自然科學基金化學學部“國家杰出青年科學基金”
1999年，“教育部科學技術進步一等獎”（第二完成人）
1999年，國家重點基礎研究發展規劃項目（973）——“組織工程的基本科學問題”有關生物材料的子課題負責人
2000年，教育部首屆“青年教師獎”
2001年，第七屆“上海市科技精英提名獎”
2001年，國家重點高技術發展項目（S863）——“新型蛋白質藥物緩釋載體”項目負責人
2002年3月，和楊玉良教授聯合指導的一篇碩士學位論文被上海市教育委員會和上海市學位委員會聯合授予“上海市研究生優秀成果（學位論文）”
2002年，“中國高校自然科學一等獎”（第二完成人）
l2003年11月，博士生張俊川和朱文分別獲得“上海市大學生發明專利獎”二等獎（申請號：01126477.2）和三等獎（申請號：03115319.4）
2004年7月，會議論文“一種新型的智能化可降解水凝膠以及作為蛋白質藥物通用緩釋載體的初步研究”（丁建東等）獲得“2004中國藥學會學術年會三等獎”（會議收到投稿近900篇，評出各類獲獎論文共57篇）